Microsoft ternyata memiliki tunggakan pajak kepada Internal Revenue Service (IRS) sebesar $28,9 miliar, belum termasuk denda dan bunga, setidaknya menurut otoritas pajak tersebut. Perusahaan teknologi ini mengungkapkan dalam pengajuan kepada Komisi Sekuritas dan Bursa (Securities and Exchange Commission) bahwa mereka menerima serangkaian Pemberitahuan Penyesuaian yang Diajukan (Notices of Proposed Adjustment atau NOPA) dari IRS untuk tahun pajak 2004 hingga 2013. Dalam pengajuan tersebut, mereka mengatakan bahwa mereka telah bekerja sama dengan IRS selama hampir satu dekade untuk menjawab pertanyaan-pertanyaan yang diajukan oleh otoritas mengenai bagaimana mereka mendistribusikan laba mereka di berbagai negara dan yurisdiksi, dan ini adalah keputusan IRS setelah penyelidikan yang panjang.
Lebih tepatnya, audit IRS berkaitan dengan praktik yang dikenal sebagai “transfer pricing,” yang secara sah memungkinkan perusahaan mengalokasikan laba dan biaya antara operasinya di berbagai wilayah. Microsoft menjelaskan bahwa banyak perusahaan multinasional besar mempraktikkan skema berbagi biaya ini untuk mencerminkan “sifat global bisnis mereka.” Dalam kasus mereka, anak perusahaan mereka berbagi dalam biaya pengembangan beberapa hak kekayaan intelektual, yang berarti mereka juga berhak atas laba terkait. Namun, seperti yang dicatat oleh AP, para kritikus regulasi ini berpendapat bahwa perusahaan seringkali menggunakannya untuk meminimalkan pajak yang harus mereka bayar dengan melaporkan laba yang lebih rendah di negara-negara dengan pajak tinggi, dan sebaliknya.
Microsoft menjelaskan bahwa masalah yang diajukan oleh IRS hanya berlaku untuk tahun-tahun yang disebutkan di atas, karena mereka telah mengubah struktur perusahaan dan praktik mereka sejak itu. Namun, IRS meyakini bahwa Microsoft berhutang $28,9 miliar pajak tertunggak. Perusahaan teknologi ini tidak setuju, seperti yang diharapkan, dan mengatakan bahwa perubahan hukum pajak yang lebih baru bisa mengurangi pajak tertunggak dari audit ini sebesar $10 miliar. Berdasarkan rencana tindakan yang mereka bagikan dengan SEC, perusahaan bermaksud untuk mengajukan banding sebaik mungkin: Microsoft mengatakan bahwa mereka akan mengejar banding di dalam IRS, yang biasanya memerlukan beberapa tahun untuk diselesaikan, dan bahkan akan “menggugat masalah-masalah yang belum terselesaikan melalui pengadilan” jika diperlukan.